Dział Finansowo – Księgowy prowadzi ewidencję księgową wszystkich zdarzeń gospodarczych odzwierciedlających działania realizowane w Agencji Rozwoju Pomorza S.A.
Działania te mają różne zasady finansowania. Są wśród nich zarówno przedsięwzięcia komercyjne, jak i finansowane z dotacji (w tym z dotacji z UE). W oparciu o przepisy polskiego i unijnego prawa dział dokonuje m.in. ustalenia przychodów i rozliczenia kosztów wydzielonych organizacyjnie i finansowo zadań realizowanych przez poszczególne działy Agencji oraz sporządza niezbędne sprawozdania, które zawierają informacje pochodzące z ksiąg rachunkowych.